В России конкурс впервые был проведен в 1994 году по инициативе Санкт-Петербургского Математического общества. Начиная с 1995 года, проведением конкурса руководит Российский оргкомитет, созданный в Санкт-Петербурге при Институте продуктивного обучения Российской академии образования.

В первом российском «Кенгуру» приняли участие всего около 300 школьников, но потом число участников стало быстро расти, и в 2012 году оно впервые превысило 2 миллиона.